Découverte d’environ 200 mutations génétiques récurrentes du nouveau virus Corona

Les mutations du SRAS-CoV-2 offrent un aperçu de l’évolution des virus.
En analysant les génomes viraux de plus de 7 500 personnes infectées par Covid-19, une équipe de recherche a caractérisé les modèles de diversité du génome du virus du SRAS-CoV-2 , offrant des indices pour développerun médicament ou un vaccin. .
L’étude, menée par l’UCL Genetics Institute, a identifié environ 200 mutations génétiques récurrentes dans le virus, soulignant comment il peut s’adapter et évoluer vers ses hôtes humains.
Les chercheurs ont découvert qu’une grande partie de la diversité génétique mondiale du SRAS-CoV-2 se trouve dans tous les pays les plus durement touchés, ce qui suggère une transmission mondiale étendue dès les premiers stades de l’épidémie et l’absence de «patients zéro» individuels dans le la plupart des pays.
Les résultats, publiés aujourd’hui, établissent également que le virus n’est apparu que récemment à la fin de 2019, avant de se propager rapidement dans le monde entier. Les scientifiques ont analysé l’émergence de la diversité génomique du SRAS-CoV- 2, le nouveau coronavirus qui cause Covid-19, grâce au dépistage du génome de plus de 7 500 virus provenant de patients infectés dans le monde. Ils ont identifié 198 mutations qui semblent s’être produites indépendamment plusieurs fois, ce qui peut contenir des indices sur la façon dont le virus s’adapte.
Le professeur François Balloux (UCL Genetics Institute), co-auteur du projet, a déclaré: «Tous les virus changent naturellement. Les mutations en elles-mêmes ne sont pas une mauvaise chose et rien ne suggère que le SRAS-CoV-2 évolue plus rapidement ou plus lentement que prévu. Jusqu’à présent, nous ne pouvons pas dire si le SRAS-CoV-2 devient plus ou moins mortel et contagieux ».
Les petits changements génétiques, ou mutations, identifiés n’étaient pas uniformément répartis dans le génome du virus. Étant donné que certaines parties du génome ont eu très peu de mutations, les chercheurs disent que ces parties invariantes du virus pourraient être de meilleures cibles pour le développement de médicaments et de vaccins.
«L’un des principaux défis pour vaincre les virus est qu’un vaccin ou un médicament peut ne plus être efficace si le virus a muté. Si nous concentrons nos efforts sur les parties du virus les moins susceptibles de muter, nous avons plus de chances de développer des médicaments qui seront efficaces à long terme », a expliqué le professeur Balloux.
« Nous devons développer des médicaments et des vaccins qui ne peuvent pas être facilement éludés par le virus. »
Lucy van Dorp (UCL Genetics Institute) a ajouté: «Il existe encore très peu de différences ou mutations génétiques entre les virus. Nous avons constaté que certaines de ces différences se sont produites plusieurs fois, indépendamment les unes des autres au cours de la pandémie – nous devons continuer à les surveiller à mesure que d’autres génomes deviennent disponibles et mener des recherches pour comprendre exactement ce qu’elles font.  »
Les résultats s’ajoutent à un nombre croissant de preuves que les virus du SRAS-CoV-2 partagent un ancêtre commun depuis la fin de 2019, ce qui suggère que c’est à ce moment-là que le virus est passé d’un hôte animal précédent à l’homme. Cela signifie que le virus qui a provoqué Covid-19 a très peu de chances d’être présent chez l’homme depuis longtemps avant d’être détecté pour la première fois.
Dans de nombreux pays, y compris le Royaume-Uni, la diversité des virus échantillonnés était presque égale à celle observée dans le monde, ce qui signifie que le virus est entré au Royaume-Uni plusieurs fois de manière indépendante, plutôt que par un seul cas d’index.
L’équipe de recherche a développé une nouvelle application en ligne interactive et open source afin que les chercheurs du monde entier puissent également examiner les génomes du virus et appliquer des approches similaires pour mieux comprendre son évolution.
Le Dr van Dorp a déclaré: « Pouvoir analyser un nombre si extraordinaire de génomes viraux dans les premiers mois de la pandémie pourrait être inestimable pour les efforts de développement de médicaments, et montre jusqu’où la recherche en génomique est allée si loin, même au cours de la dernière décennie. Nous bénéficions tous d’un énorme effort de centaines de chercheurs à travers le monde qui ont séquencé les génomes du virus
Lors de recherches sur le nouveau virus corona, les scientifiques allemands ont pu mettre en évidence des anticorps qui empêchent le virus de pénétrer dans les cellules.
Luka Cicin-Sain du Braunschweig Helmholtz Center for Infection Research et son équipe auraient analysé 6 000 anticorps artificiels différents. Les chercheurs ont trouvé plus de 750 anticorps qui s’accrochent au virus corona – une condition préalable pour lutter avec succès contre l’agent pathogène. Maintenant, les anticorps sont testés pour leur efficacité sur des cultures cellulaires.
Le but des scientifiques n’est pas la vaccination mais un médicament pour traiter de manière aiguë les patients corona gravement malades.
La recherche du meilleur candidat anticorps pour un médicament ultérieur devrait se poursuivre jusqu’à la mi-juin, a déclaré Thomas Schirrmann de la société de biotechnologie Yumab impliquée dans le projet. « Notre vision est que les premiers patients corona seront traités avec le médicament à l’automne », a déclaré Schirrmacher.
La société pharmaceutique américaine Gilead recherche des fabricants de produits chimiques et pharmaceutiques pour son médicament expérimental Covid-19 Remdesivir. La société est en pourparlers sur la construction d’un consortium de partenaires de fabrication pour assurer un approvisionnement mondial jusqu’en 2022, a déclaré Gilead mardi soir.
Le médicament nécessite des matières premières rares et une capacité de fabrication spécialisée pour sa fabrication. Des licences à long terme seraient négociées avec plusieurs fabricants de génériques en Inde et au Pakistan pour produire du remdesivir pour les pays en développement. L’un des plus grands fabricants pharmaceutiques du Bangladesh, Beximco Pharmaceuticals, commencera la production de remdesivir ce mois-ci,
Contrairement aux rumeurs contraires de ces derniers jours, une nouvelle positive est à présent venue concernant le médicament Remdesivir de la société américaine Gilead Sciences. Selon l’expert en épidémie et conseiller du gouvernement américain, il est susceptible de devenir un traitement standard pour COVID-19. Le directeur de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses (NIAID), Anthony Fauci, a qualifié les premiers résultats d’une étude mercredi de « vraiment très importants ». Les résultats devraient encore être vérifiés et publiés de manière indépendante, mais les indications d’une durée de maladie nettement plus courte sont prometteuses, a déclaré l’immunologue Fauci.
L’étude clinique a impliqué 1 063 patients COVID-19 aux États-Unis, en Europe et en Asie. Ils ont reçu soit Remdesivir, qui a été initialement développé pour Ebola, soit un placebo. Selon les résultats de l’étude préliminaire, les patients traités par le remdesivir ont mis en moyenne onze jours pour récupérer, tandis que les patients recevant le placebo ont mis 15 jours. Cela montre que le médicament peut « bloquer » le nouveau coronavirus, a déclaré Fauci. Le remdesivir a montré un « effet significativement positif en réduisant le temps de récupération ».
La Food and Drug Administration des États-Unis (FDA) est actuellement en pourparlers avec Gilead pour mettre rapidement le remdesivir à la disposition des patients hospitalisés, a déclaré Fauci. Cependant, l’approbation officielle du médicament prendrait beaucoup plus de temps et nécessiterait d’autres études.
La société pharmaceutique britannique Astra Zeneca espère les premiers résultats cet été sur un vaccin contre le coronavirus. C’est un risque d’investir dans ce développement de projet car le succès n’est pas certain, a déclaré le PDG Pascal Soriot. « Mais il est maintenant temps de prendre un tel risque. » En juin ou juillet, il devrait être clair si l’Université d’Oxford est sur la voie du succès dans le développement du vaccin. « C’est une crise terrible à laquelle nous sommes confrontés et nous avons besoin de solutions, et bien sûr, un vaccin est l’outil le plus important pour y faire face », a déclaré Soriot. «L’accord que nous avons avec le gouvernement et aussi avec le Groupe d’Oxford est que nous livrerons le vaccin au prix coûtant au moment de la pandémie. «Astra Zeneca devrait fabriquer et lancer le vaccin corona potentiel développé par l’Université d’Oxford et le Jenner Institute. L’entreprise a conclu un accord avec l’université. Le vaccin britannique est actuellement testé sur l’homme.
Selon les données disponibles jusqu’à présent, les principales organisations de recherche en Allemagne conviennent qu’un confinement cohérent du coronavirus SARS-CoV-2 est actuellement la « seule stratégie raisonnable » d’un point de vue épidémiologique « .